1.審計追蹤液相色譜流動相必須用HPLC級的試劑，使用前過濾除去其中的顆粒性雜質和其他物質(使用0.45μm或更細的膜過濾)。

　　2.流動相過濾後要用超聲波脫氣，脫氣後應該恢複到室溫後使用。

　　3.不能用純乙腈作為流動相，這樣會使單向閥粘住而導致泵不進液。

　　4.使用緩衝溶液時，做完樣品後應立即用去離子水衝洗管路及柱子一小時，然後用甲醇(或甲醇水溶液)衝洗40分鍾以上，以充分洗去離子。對於柱塞杆外部，做完樣品後也必須用去離子水衝洗20mL以上。

　　5.長時間不用儀器，應該將柱子取下用堵頭封好保存，注意不能用純水保存柱子，而應該用有機相(如，甲醇等)，因為，純水易長黴。

　　6.每次做完樣品後應該用溶解樣品的溶劑清洗進樣器。

　　7.C18柱不能進蛋白樣品，血樣、生物樣品。

　　8.審計追蹤液相色譜堵塞導致壓力太大，按預柱→混合器中的過濾器→管路過濾器→單向閥檢查並清洗，清洗方法：

　　①以異丙醇作溶劑衝洗；

　　②放在異丙醇中間用超聲波清洗；

　　③用10％稀硝酸清洗；

　　9.氣泡會致使壓力不穩，重現性差，所以在使用過程中要盡量避免產生氣泡。

　　10.如果進液管內不進液體時，要使用注射器吸液：通常在輸液前要進行流動相的清洗。

　　11.要注意柱子的pH值範圍，不得注射強酸強堿的樣品，特別是堿性樣品。

　　12.審計追蹤液相色譜更換流動相時應該先將吸濾頭部分放入燒杯中邊振動邊靖洗，然後插入新的流動相中。更換無互溶性的流動相時要用異丙醇過渡一下。